瞄准国际发展动态和科学前沿，面向国家重大需求，大力推进学科交叉研究，发挥在流域水环境综合治理的优势特色，开展深入的科学研究和技术研发工作。先后主持包括国家“973”计划项目（课题）、国家重大研发计划项目（课题）、国家自然科学基金创新群体项目、杰出青年基金项目、重点项目和国家重大水专项等一批立足解决我国水环境领域重大科学问题和技术难题的科研课题。依托高层次科研项目，取得了一系列具有自主知识产权的创新性科研成果并直接服务于国家水生态文明建设，产出多项标志成果被直接应用于我国长江、太湖、黄河、淮河、珠江等流域及各城市、城乡的河流综合治理、水污染控制、水质改善与生态修复、饮用水安全保障工程及底泥生态疏浚与固化资源化利用工程中取得显著的经济、社会及生态环境效益。